針對有學者批評原住民專業法庭的法官「不專業」，司法院秘書長呂太郎表示，全國逾2000名法官中，真正具有原住民身分者僅三位，為了讓法官適切審理原住民有關案件，司法院每年都會舉辦研習營或體驗營，讓法官深入部落，親身去體驗原住民的傳統文化。
呂太郎說，例如，去年司法院即辦理屏東縣牡丹鄉、嘉義縣那瑪夏部落的生活體驗營，有許多法官熱烈參與；司法院也會邀請原住民委員會主委或是熟悉原住民法律的學者辦演講，讓法官深入了解原住民生活的特殊性，以做為審理原住民有關案件時心證的形成。
呂太郎表示，現任監察院副院長孫大川過去擔任原住民委員會主委時，就經常針對原住民事務定期舉辦法律講座，講授的對象都是現職法官，目的即是彌補原住民專業法庭法官對原住民生態陌生的缺憾，並以此讓專庭的法官審理案件時，不致於發生判斷上的錯誤。
